| Chikungunya nsP2 Protonation Dynamics: Predictors and Constant pH Simulation |
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2023 |
| In silico Evaluation of a Potential Selective Inhibitor for Chagas Disease Treatment |
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2023 |
| Análise da conservação de proteínas de canais RND em *Pseudomonas aeruginosa' |
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2023 |
| RND SYSTEM: A COMPARISON OF THE PROTEINS THAT INTEGRATE THE RND SYSTEM IN PSEUDOMONAS AERUGINOSA GENOME |
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2022 |
| ANÁLISES IN SILICO DE PRODUTOS NATURAIS DA BIODIVERSIDADE BRASILEIRA NO TRATAMENTO DA COVID-19: BANCO DE DADOS NUBBE CONTRA PLPRO DE SARS-COV-2 |
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2022 |
| PREDIÇÃO IN SILICO DE POSSÍVEIS INIBIDORES DA PLPRO DE SARS- COV-2 A PARTIR DOS INSUMOS FARMACÊUTICOS ATIVOS PRESENTES NA FARMACOPEIA BRASILEIRA |
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2022 |
| POTENCIAL ATIVIDADE IN SILICO DE FENILPROPANOIDES GLICOSILADOS [FRENTE INIBIDORES DE PROTEASES DE SARS-COV-2] E SUA CORRELAÇÃO COM A MEDICINA TRADICIONAL CHINESA (MTC) |
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2022 |
| CHIKUNGUNYA NSP2 VIRTUAL SCREENING PARAMETRIZATION: DECOY GENERATION AND MOLECULAR DOCKING |
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2022 |
| INVESTIGAÇÃO DE NOVOS ALVOS MOLECULARES NO GENOMA DE TRYPANOSOMA CRUZI ATRAVÉS DE FERRAMENTAS COMPUTACIONAIS de autoria LORRANA FARIA FONSECA, MANUELA LEAL DA SILVA e RAÍSSA SANTOS DE LIMA ROSA |
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2022 |
| VIRTUAL SCREENING OF ANVISA APPROVED APIS IN SARS-COV-2 PLPRO |
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2022 |
| IN SILICO INVESTIGATION OF NATURAL PRODUCTS AS POSSIBLE INHIBITORS OF SARS-COV-2 PROTEASE 3CLPRO |
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2022 |
| ARGININA QUINASE DE T. CRUZI: POSSÍVEL ALVO TERAPÊUTICO PARA O TRATAMENTO DA DOENÇA DE CHAGAS |
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2021 |
| In silico analysis of Flavonoids from Siparuna cristata against SARS‐CoV‐2 PLpro : Natural products in the treatment of COVID-19 |
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2021 |
| FLAVONOIDS FROM SIPARUNA CRISTATA INHIBITORS AGAINST SARS- COV-2 3CLPRO? AN IN SILICO INVESTIGATION |
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2021 |
| IN SILICO ANALYSIS OF NATURAL PRODUCTS FROM BRAZILIAN BIODIVERSITY IN COVID-19 TREATMENT: NUBBEDB AGAINST SARSCOV2 PLPRO |
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2021 |
| STRATEGIES OF RANKING METHODS FOR VIRTUAL SCREENING IN SARS- COV-2 PLPRO |
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2021 |
| In silico screening of phenylethanoid glycosides as potential natural inhibitors of SARS-CoV-2 proteases |
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2021 |
| ANÁLISE IN SILICO DE PRODUTOS NATURAIS DA BIODIVERSIDADE BRASILEIRA NO TRATAMENTO COVID-19: NUBBEDB CONTRA SARS-COV-2 PLPRO |
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2021 |
| INVESTIGATION OF NEW THERAPEUTIC TARGETS IN TRYPANOSOMA CRUZI GENOME USING DIFFERENT COMPUTATIONAL APPROACHES |
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2021 |
| INVESTIGAÇÃO DE NOVOS ALVOS TERAPÊTICOS NO GENOMA DO TRYPANOSOMA CRUZI USANDO DIFERENTES ABORDAGENS COMPUTACIONAIS |
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2021 |
| In silico screening of phenylethanoid glycosides as potential natural inhibitors of SARS-CoV-2 proteases |
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2021 |
| Aplicação de ferramentas de predição de epítopos de células T no desenvolvimento de novos métodos diagnósticos para o vírus da Dengue |
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2020 |
| Predição de regiões antigênicas a célula B como ferramenta ao desenvolvimento de novos métodos diagnósticos para Arboviroses |
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2020 |
| Modelagem Tridimensional da Serina Hidroximetiltransferase de Trypanosoma cruzi: possível alvo para terapia antiparasitária |
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2020 |
| VIRTUAL SCREENING USING APPROVED DRUGS: IN SILICO EVALUATION OF ANTI HAT POTENTIALS. |
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2020 |
| BUSCA DE NOVOS ALVOS TERAPÊUTICOS PARA TRATAMENTO DE LEISHMANIOSE TEGUMENTAR UTILIZANDO PREDIÇÃO FUNCIONAL DE PROTEÍNAS |
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2020 |
| REPOSICIONAMENTO DE FÁRMACOS PARA A PROTEÍNA DIHIDROFOLATO REDUTASE - TIMIDILATO SINTASE DE PLASMODIUM FALCIPARUM |
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2020 |
| Divulgação cientifica durante a pandemia: a criação da coleção de cartilhas De olho na COVID-19 |
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2020 |
| Busca de Novos Alvos Moleculares Através da Predição Funcional de Proteínas com Função Desconhecida de Trypanosoma cruzi. |
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2020 |
| IN-SILICO ANALYSIS OF THE STRUCTURE AND BINDING SITE FEATURES OF THE 3CL PROTEASE FROM SARS-COV-2: PARAMETERIZATION FOR VIRTUAL SCREENING PROTOCOLS |
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2020 |
| COMPUTATIONAL METHODS FOR PARAMETERIZATION OF THE SARS-COV-2 3CLpro STRUCTURE: A STEP TOWARDS TESTING NEW INHIBITORS |
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2020 |
| IN-SILICO ANALYSIS OF PAPAIN-LIKE PROTEASE FROM SARS-COV-2: DEFINING VIRTUAL SCREENING PARAMETERS FOR DRUG REPURPOSING |
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2020 |
| Aplicação de modelos farmacocinéticos e toxicológicos in sílico visando a busca de compostos com potencial antiviral |
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2019 |
| Caracterização dos diferentes subtipos da HIV protease e busca por novos candidatos à fármacos |
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2019 |
| ASADrug: uma nova plataforma para desenvolvimento de fármacos |
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2019 |
| Modelagem 3D da enzima Glutamina-frutose-6-fosfato amidotransferase (GlmS) de Pseudomonas aeruginosa: possível alvo de terapia antimicrobiana |
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2019 |
| Aplicações de enzimas termoestáveis na biotecnologia |
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2019 |
| Predição funcional de proteínas com função hipotética de Trypanosoma cruzi |
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2019 |
| Utilização de ferramentas in silico para descoberta de novos sítios catalíticos e secundários em proteínas: aplicação na falcipaína-2 de Plasmodium falciparum |
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2019 |
| Estudo proteico do Hepavirus C voltado ao reposicionamento de fármacos in silico |
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2019 |
| Caracterização de Propriedades Sequenciais de Peptídeos Antimicrobianos e Perfis de Membranas Biológicas através de Ferramentas Computacionais |
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2019 |
| Avaliação e comparação das mutações entre as proteases do HIV-1 subtipo B e F e suas influências nos inibidores de protease |
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2019 |
| Reposicionamento In Silico de Substâncias Aprovadas pelo FDA para Tratamento de Malária e Tuberculose |
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2019 |
| Identificação de sítios inibitórios da porção Timidilato Sintase da DHFR-TS de Plasmodium falciparum e Triagem Virtual de Possíveis Candidatos a Fármacos no Tratamento da Malária |
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2019 |
| Identificação de sítios catalíticos e secundários da Dihidrofolato Redutase ? Timidilato Sintase de Plasmodium falciparum e Triagem Virtual de Possíveis Candidatos a Fármacos no Tratamento da Malária |
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2019 |
| PREDIÇÃO DE NOVAS FUNÇÕES DA BACTÉRIA EXTREMOFÍLICA DEINOCOCCUS RADIODURANS ATRAVÉS DA ANÁLISE COMPUTACIONAL DE SUAS PROTEÍNAS |
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2019 |
| Reposicionamento racional de fármacos para o tratamento de tuberculose: aplicação em DPRE1 de Mycobacterium tuberculosis |
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2019 |
| CARACTERIZAÇÃO DO PERFIL SEQUENCIAL DE PEPTÍDEOS ANTIMICROBIANOS ATRAVÉS DE FERRAMENTAS COMPUTACIONAIS |
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2019 |
| ESTUDO PROTEICO DO HEPACIVIRUS VOLTADO AO REPOSICIONAMENTO DE COMPOSTOS IN SILICO |
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2019 |
| DETERMINAÇÃO DE POSSÍVEIS SÍTIOS SECUNDÁRIOS NA FALCIPAÍNA-2 DE PLASMODIUM FALCIPARUM ATRAVÉS DE FERRAMENTAS IN SILICO |
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2019 |
| PREDIÇÃO ESTRUTURAL DE PROTEÍNAS RELACIONADAS À LESÕES FOCAIS NO CORTEX CEREBRAL |
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2019 |
| Predição funcional de proteínas com função hipotética de Trypanossoma cruzi |
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2019 |
| AGNINetworks: Redes Neurais Convolucionais como funções de compatibilidade entre ligante e receptor em ensaios de Ancoragem molecular |
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2019 |
| Caracterização dos diferentes subtipos da HIV protease e busca por novos candidatos à fármacos |
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2019 |
| Predição estrutural de proteínas da Leishmania braziliensis: foco na busca de novos alvos terapẽuticos para o tratamento de leishmaniose |
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2019 |
| Busca por novos alvos moleculares na terapia antimicrobiana |
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2019 |
| Docking molecular como ferramenta para identificação de agentes antivirais contra flavivirus |
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2019 |
| ASSOCIATION BETWEEN ROTENONE AND PARKINSON?S DISEASE: EFFECTS ON THE GENE AND PROTEIN EXPRESSION OF UBIQUITIN IN ASCIDIANS |
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2019 |
| ASADRUG: A PLATFORM FOR DRUG DESIGN |
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2018 |
| PLANNING IN SILICO OF CANDIDATES TO DRUG PROTOTYPES FOR THE TREATMENT OF TUBERCULOSIS |
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2018 |
| DRUG RESISTANT GENES ON MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS |
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2018 |
| IN SILICO EVALUATION OF TARGET ENZYMES FOR POTENTIAL ANTI-TUBERCULOSIS DRUGS |
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2018 |
| Análise in silico de Possíveis Alvos Moleculares da Quercetina no Tecido Muscular Esquelético |
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2018 |
| Predição funcional: anotação sequencial versus anotação estrutural. Aplicação em Mycobacterium tuberculosis |
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2018 |
| Metanálise quantitativa de proteínas relacionadas ao Hepacivírus C |
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2018 |
| Desenvolvimento do portal ASAProt: Sistema Computacional para Anotação Estrutural em Larga Escala |
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2018 |
| SASBT: Uma Nova Ferramenta para Busca de Alvos Biológicos em Amostras Sequenciadas por Métodos Baseados em Shotgun |
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2018 |
| ASADock: Um Servidor Web para Triagem Virtual de Compostos que Agrega Resultados de Ensaios Bioquímicos |
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2018 |
| Análise in silico de enzima DprE1: avaliação de protótipos de fármacos para o tratamento da tuberculose |
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2018 |
| In Silico Search for Possible Skeletal Muscle Receptor to Quercetin |
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2018 |
| In silico Search of a Specific Inhibitor for Alternative Treatment Leishmaniasis |
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2018 |
| Protein functional prediction in genomic scale by structural modeling |
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2017 |
| ASADOCK: a web server for compound screening that aggregates biochemical assay results |
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2017 |
| Asadock: a Plataform to Accelerate rational Drug Design |
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2017 |
| Protein Functional Prediction: Sequencial Annotation versus Structural Annotation on Treponema Pallidum |
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2017 |
| A New Virtual Screening Method to Search for Enzyme Inhibitors by Machine Learning and Protein Information |
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2017 |
| Protein Functional Prediction on Mycobacterium tuberculosis |
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2017 |
| Functional Prediction of Tepidanaerobacter acetoxydans Proteins and Search for New Molecular Targets Related to the Production of Biogas |
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2017 |
| Development of an Automated Molecular Docking Protocol: Case study of Different Subtype HIV-1 Protease Activity |
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2017 |
| SARGA3NS, a New Tool for Search and Assembly of Biological targets: the Development and Application on Biofuls Production Related proteins |
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2017 |
| Development of New Methodologies Applied to Reference-based Assembly of Short Peptides Sequences from Metagenome Samples |
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2017 |
| Functional Prediction of Stress-Modulated Proteins of Deinococcus radiodurans |
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2017 |
| Functional prediction of stress-modulated proteins of Deinococcus radiodurans |
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2017 |
| Análise da aplicação de métodos automatizados embasada em anotação estrutural de sequências proteicas da bactéria endofítica Gluconacetobacter diazotrophicus |
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2016 |
| MOLECULAR MODELING OF EXTREMOPHILIC-RELATED PROTEINS OF DEINOCOCCUS RADIODURANS |
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2016 |
| STRUCTURAL FEATURES OF 24-C-STEROL-METHYLTRANSFERASE FROM TRYPANOSOMA BRUCEI |
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2016 |
| In silico analysis 24-C-Sterol Methyltransferase from Trypanosoma cruzi: structure and interactions with inhibitors |
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2016 |
| DOCKING AND MOLECULAR DYNAMICS OF GLYCOSYL HYDROLASES FROM ACHATINA FULICA?S METAGENOME TO 2G ETHANOL PRODUCTION |
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2016 |
| Identification and evaluation of new molecular targets: from metagenome analysis to 3D structure |
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2016 |
| Modelagem Molecular de Proteínas Relacionadas à Extremofilia em Deinococcus radiodurans |
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2016 |
| The Combination between artificial prediction of natural substrates proteins |
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2016 |
| Inteligência Artificial aliada ao Docking Molecular na Predição de Substratos Naturais de Proteínas |
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2016 |
| ASAProt (Automatic Structural Annotation of Proteins): Automação do Sistema Computacional para Anotação de Proteínas em Larga Escala |
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2015 |
| Annotation, Modelling And Molecular Dynamics Of A 6-Phospho-Β-Glucosidase From Citrobacter spp, Prospected From The Crop Metagenome Of Giant Snail Achatina fulica. |
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2015 |
| Software Development for Compound Screening on Molecular Targets of Neglected Tropical Diseases |
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2015 |
| Identification Of Protein Domains By Bioinformatics Tools In Large Scale. |
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2015 |
| Artificial Intelligence Applied To Search Of Enzymatic Inhibitors In Data Banks Of Chemical Compounds |
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2015 |
| ASAProt (Automatic Structural Annotation Of Proteins): Validating The Efficacy Of Automated Method To Large Scale Structural Annotation |
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2015 |
| Web Server and Parameter Definition for Compound Screening on Molecular Targets of Neglected Tropical Disieases |
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2015 |
| Identification of Lignocellulose Enzymes Isolated Through Metagenomic Approach by Bioinformatics Tools |
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2015 |
| Análise de redução dimensional na representação de dados biológicos utilizando aprendizagem de máquina e substratos naturais de proteínas |
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2015 |
| Evaluation of the influence of the use of imbalanced data in biological problems. |
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2015 |
| Discovering Experimental Errors In Silico: Modeling And Design Of The C-Terminal Of An Endoglucanase From Serratia Sp. Originated From The Crop Metagenome Of The Mollusk Achatina Fulica |
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2015 |
| Analysis of the accuracy of the validation criteria of the ASAProt (Automatic Structural Annotation of Proteins). |
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2015 |
| Avaliação de métodos de classificação de substratos naturais de proteínas utilizando métodos de aprendizagem de máquina |
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2015 |
| Interações Moleculares de Uma 6-Fosfo-Beta-Glicosidase De Citrobacter Sp, Oriunda Do Metagenoma gástrico Do Molusco Achatina fulica, Com Seu Substrato E Co-Fator: Um Estudo De Anotação, Modelagem Comparativa, Predição De Substratos E Simulações De Dinâmica Molecular |
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2015 |
| Asaprot (Automatic Structural Annotation Of Proteins): Validação Da Eficácia Dos Métodos Automatizados Para Anotação Estrutural Em Larga Escala. |
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2015 |
| Analysis of the accuracy of ASAProt (Automatic Structural Annotation of Proteins). |
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2015 |
| Development Of Computational Tools For Biological Data Analysis And Proteins Identification From Metagenome Samples |
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2015 |
| Alternative Model for RND-Type Efflux Pump. |
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2015 |
| MODELAGEM MOLECULAR DE PROTEÍNAS RELACIONADAS À EXTREMOFILIA EM DEINOCOCCUS RADIODURANS |
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2015 |
| STRUCTURAL ATTRIBUTES OF 24-C-STEROL-METHYLTRANSFERASE FROM TRYPANOSOMA CRUZY |
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2015 |
| ANOTAÇÃO E MODELAGEM DE ENDOGLUCANASE DE SERRATIA SP ORIUNDA DO METAGENOMA DO CARAMUJO AFRICANO ACHATINA FULICA. |
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2014 |
| ANOTAÇÃO E MODELAGEM ESTRUTURAL DA ENDO-1,4-DGLUCANASE DE STENOTROPHOMONAS SP. PROVENIENTE DO METAGENOMA DO CARAMUJO ACHATINA FULICA |
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2014 |
| STRUCTURAL ANNOTATION OF SEQUENCES FROM THE ENDOPHYTIC BACTERIUM GLUCONACETOBACTER DIAZOTROPHICUS USING ASAPROT |
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2014 |
| IDENTIFICATION AND MODELING OF A GH9 CELLULASE FROM ACHATINA FULICA'S METAGENOME. |
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2014 |
| Phenotypic Assay and Computational Analysis of NS3 protease from Hepatitis C Viirus |
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2014 |
| Automação do workflow ASAProt: Sistema Computacional para Anotação Estrutural em Larga Escala |
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2014 |
| Identificação e modelagem de celulases GH3 e GH9 oriundas do metagenoa de Achatina fulica |
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2014 |
| Anotação e Modelagem de uma 6-fosfo-beta-glicosidase oriunda do metagenoma do caramujo africano Achatina fulica |
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2014 |
| Estudos de Bioinformática e Modelagem Molecular de Enzimas Oriundas do Caramujo Achatina fulica Potencialmente Envolvidas na Degradação de Celulose |
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2014 |
| Annotation And Structural Modeling Of B-Glucosidase Of Tolumonas Auensis From Metagenome Of Achatina fulica Potentialy Involved In Degradation Of Cellulose. |
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2014 |
| Identification And Modeling Of GH3 And GH9 Cellulases From Achatina fulica`S |
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2014 |
| Annotation and modelling of a diacetylchitobiose-6-phosphate hydrolase from giant snail Achatina fulica gastric acid metagenome |
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2014 |
| ASAProt (Automatic Structural Annotation of Proteins): Validação Da Eficácia Dos Metódos Automatizados Para Anotação Estrutural Em Larga Escala |
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2014 |
| Otimização Do Modelo Estrutural De Uma 6-Fosfo-Beta-Glicosidase De Citrobacter Sp, Com Potencial Para O Metabolismo De Produtos Inibitórios De Celulases |
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2014 |
| Identificação E Modelagem De Celulases GH3 e GH9 Orinudas do Metagenoma de Achatina fulica. |
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2014 |
| Modelagem Estrutural De Enzimas Do Caramujo Achatina fulica Potencialmente Envolvidas Na Degradação De Celulose |
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2014 |
| Identification of Enzymes that Degrade Cellulose from the crop of the Achatina's fulica metagenome |
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2014 |
| Structural annotation of genome sequences from the endophytic bacterium Gluconacetobacter diazotrophicus |
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2014 |
| Anotação e modelagem de uma glicosil hidrolase proveniente do metagenoma do cuco gástrico de Achatina fullica |
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2013 |
| Modelagem estrutural de enzimas provenientes do metagenoma do caramujo Achatina fulllica potencialmente envolvidas na degradação de celulose |
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2013 |
| Descrição do comportamento das moléculas orgânicas NPB e TPD do ponto de vista molecular |
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2013 |
| Desenvolvimento de ferramentas computacionais para anotação estrutural em larga escala |
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2013 |
| Anotação e modelagem comparativa da quitinase de Stenophomonas sp. oriunda do metagenoma do suco gástrico de Achatina fulica |
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2013 |
| Annotation and modelling a glycoside hydrolase enzyme from Achatina fullica's gastric metagenome |
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2013 |
| Structural modeling of enzymes from the metagenome of the snail Achatina fulica potentially involved in cellulose degradation |
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2013 |
| Three-dimensional models of NS3/4A protease containing resistance mutations to protease inhibitors from patients with chronic hepatitis C protease inhibitors naive |
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2013 |
| The putative RND-type efflux system in Gluconacetobacter diazotrophicus |
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2012 |
| Three-dimensional models of NS3 protease containg primary resistance mutations to protease inhibitors from chronically infected HCV patients |
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2012 |
| Análise in silico do envolvimento da PTO-like tirosina cinase na interação entre Gluconacetobacter diazotrophicus e cana-de-açúcar |
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2011 |
| Modelagem estrutural de proteínas de cana-de-açúcar diferencialemte expressas devido a presença da bactéria endofítica Gluconacetobacter diazotrophicus |
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2011 |
| Modelagem Estrutural de Proteínas de Cana-de-açúcar Diferencialmente Expressas Devido a Presença da Bactéria Endofítica Gluconacetobacter diazotrophicu |
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2011 |
| Structural Modeling of Differentially Expressed Sugarcane Proteins Induced by the Presence of the Endophytic Bacteria G. diazotrophicus |
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2011 |
| Anotação estrutural do genoma da bactéria endofitica Gluconacetobacter diazotrophicus utilizando MHOLline |
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2010 |
| Análise estrutural da glutamina sintetase de cana-de-açúcar |
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2010 |
| Análise estrutural da glutamina sintetase de cana-de-açúcar |
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2010 |
| Structural analysis of sequences from the endophytic bacterium Gluconacetobacter diazotrophicus genome using MHOLline |
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2010 |
| Anotação estrutural do genoma da bactéria endofitica Gluconacetobacter diazotrophicus utilizando MHOLline |
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2010 |
| Comparative modeling of Gluconacetobacter diazotrophicus proteins involved in plant-bacteria association |
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2009 |
| Gene characterization and 3d comparative modeling to ClpB104 chaperone protein of Trypanosoma cruzi |
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2009 |
| Bioinformatics studies of SHR5: a receptor-like kinase (RLK) from Saccharum spp. involved in plant endophytic bacteria association |
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2009 |
| Absence of EROD activity in fish: The curious case of Pterygoplichthys CYP1A |
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2009 |
| Structural analysis of outer membrane efflux proteins from Gluconacetobacter diazotrophicus |
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2009 |
| Análise Estrutural de Proteínas de Efluxo da Membrana Externa de Gluconacetobacter diazotrophicus |
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2009 |
| Bioinformatcs studies of Gluconacetobacter diazotrophycus genome: predictions of transmembrane helices and topology of proteins |
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2008 |
| Analysis of outer and cytoplasmic membranes proteins from Gluconacetobacter diazotrophicus using MHOLline |
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2008 |
| Analysis of outer and cytoplasmic membranes proteins from Gluconacetobacter diazotrophicus using MHOLline |
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2008 |
| Docking and Molecular Dynamics Studies in the Design of Selective Inhibitors for Plasmodium falciparum Serine Hydroxymethyl Transferase. |
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2007 |
| Design of 5-Formyl-6-hydrofolic Acid Analogues as New Potential Antimalarials Targeting P.falciparum Serine Hydroxymethyltransferase |
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2006 |